R Bioinformatics Cookbook: Utilize R packages for bioinformatics, genomics, data science, and machine learning
4.5
بر اساس نظر کاربران
شما میتونید سوالاتتون در باره کتاب رو از هوش مصنوعیش بعد از ورود بپرسید
هر دانلود یا پرسش از هوش مصنوعی 2 امتیاز لازم دارد، برای بدست آوردن امتیاز رایگان، به صفحه ی راهنمای امتیازات سر بزنید و یک سری کار ارزشمند انجام بدینکتاب های مرتبط:
خلاصه تحلیلی کتاب
کتاب R Bioinformatics Cookbook اثری عملی و راهبردی است که به پژوهشگران، دانشجویان و متخصصان داده کمک میکند تا با استفاده از توانمندیهای زبان R در حوزههای bioinformatics، genomics، data science و machine learning پیشرفت کنند. این کتاب از ساختار «cookbook» بهره میگیرد؛ یعنی هر فصل شامل دستورالعملهایی گامبهگام برای حل مسائل مشخص و واقعی در این زمینههاست.
خواننده با مرور این اثر، میآموزد چگونه دادههای پیچیده زیستی را پردازش، تحلیل و مصورسازی کند. نویسنده با زبانی ساده اما علمی، مسیرهای مختلف استفاده از بستههای تخصصی R را بیان کرده و با مثالهای عملی، امکان پیادهسازی سریع راهکارها را در پروژههای واقعی فراهم ساخته است.
این کتاب نهتنها به افرادی که پیشینه برنامهنویسی دارند، بلکه به پژوهشگران حوزههای زیستشناسی، ژنتیک و حتی علوم پزشکی که به دنبال ورود کاربردی به دنیای تحلیل دادههای زیستی هستند، پیشنهاد میشود. این رویکرد میانرشتهای موجب شده تا R Bioinformatics Cookbook به پلی میان علم داده و علوم زیستی تبدیل شود.
نکات کلیدی و کاربردی
یکی از برجستهترین نکات کتاب، تمرکز بر بستههای کاربردی R در bioinformatics است؛ بستههایی مانند Bioconductor که بستر قدرتمندی برای تحلیل دادههای ژنومی فراهم میکند. این تمرکز بر ابزارهای معتبر و پرکاربرد، زمان یادگیری را بهطرز محسوسی کاهش میدهد.
دومین نکته پراهمیت، ارائه مثالهای واقعی از دادههای زیستی، از توالییابی ژنوم تا تجزیهوتحلیل دادههای بیان ژن. این مثالها به خواننده کمک میکنند تا نهتنها اصول نظری را درک کند بلکه بتواند آن را در پروژههای تحقیقاتی خود پیادهسازی نماید.
تمرکز دیگر کتاب روی فرآیند مصورسازی دادهها با R است؛ از گرافهای ساده تا نمودارهای پیچیده heatmap برای نمایش دادههای بیان ژن. این رویکرد به بهبود تفسیر نتایج کمک میکند و ارتباط یافتههای علمی با مخاطبان غیرتخصصی را تسهیل میسازد.
همچنین کتاب روشهایی برای بهینهسازی کدها و استفاده مؤثر از منابع محاسباتی را پوشش میدهد که در پروژههای حجیم، بسیار حیاتی است.
نقلقولهای ماندگار
هر کتاب علمی خوب، معمولاً جملاتی دارد که در ذهن خواننده میماند. در R Bioinformatics Cookbook نیز بخشهایی وجود دارد که نگاه تخصصی نویسنده به روند تحلیل دادههای پیچیده را آشکار میکند.
این نقلقولها نهتنها برای بهیادآوری مفاهیم کلیدی، بلکه بهعنوان الهام برای شروع یا ادامه مسیر پژوهشگری کاربرد دارند. نویسنده تلاش کرده تا بهجای بیان خشک مفاهیم، تجربه کاری و بینش شخصی خود را به خواننده منتقل کند.
"برای درک دادههای زیستی، تنها به ابزار نیاز ندارید، بلکه باید یاد بگیرید چگونه از آنها داستان بسازید." نامشخص
"مصورسازی درست، پلی است میان کشف علمی و درک انسانی." نامشخص
چرا این کتاب اهمیت دارد
در عصر دادههای بزرگ، بهویژه در حوزه علوم زیستی، توانایی کار با زبانهای برنامهنویسی تخصصی همچون R یک مزیت رقابتی محسوب میشود. کتاب R Bioinformatics Cookbook با ارائه دستورالعملهای عملی، این شکاف مهارتی را پر میکند.
این کتاب نهتنها به تحلیل دادههای موجود کمک میکند، بلکه رویکردی را میآموزد که پژوهشگران را برای مواجهه با چالشهای آینده آماده میسازد. از طراحی آزمایشهای جدید گرفته تا بهینهسازی الگوریتمهای تحلیل، این اثر نقش مهمی در پیشبرد علم دارد.
به دلیل بهرهگیری از ساختار cookbook، پژوهشگر میتواند مسائل خاص خود را انتخاب کرده و بدون نیاز به مطالعه خط به خط کل کتاب، راهحل مربوطه را بیابد. این ویژگی برای کسانی که بهدنبال صرفهجویی در زمان هستند، ارزشمند است.
Discover over 80 recipes for modeling and handling real-life biological data using modern libraries from the R ecosystem Key Features Apply modern R packages to process biological data using real-world examples Represent biological data with advanced visualizations and workflows suitable for research and publications Solve real-world bioinformatics problems such as transcriptomics, genomics, and phylogenetics Purchase of the print or Kindle book includes a free PDF eBook Book DescriptionThe updated second edition of R Bioinformatics Cookbook takes a recipe-based approach to show you how to conduct practical research and analysis in computational biology with R. You’ll learn how to create a useful and modular R working environment, along with loading, cleaning, and analyzing data using the most up-to-date Bioconductor, ggplot2, and tidyverse tools. This book will walk you through the Bioconductor tools necessary for you to understand and carry out protocols in RNA-seq and ChIP-seq, phylogenetics, genomics, gene search, gene annotation, statistical analysis, and sequence analysis. As you advance, you'll find out how to use Quarto to create data-rich reports, presentations, and websites, as well as get a clear understanding of how machine learning techniques can be applied in the bioinformatics domain. The concluding chapters will help you develop proficiency in key skills, such as gene annotation analysis and functional programming in purrr and base R. Finally, you'll discover how to use the latest AI tools, including ChatGPT, to generate, edit, and understand R code and draft workflows for complex analyses. By the end of this book, you'll have gained a solid understanding of the skills and techniques needed to become a bioinformatics specialist and efficiently work with large and complex bioinformatics datasets.What you will learn Set up a working environment for bioinformatics analysis with R Import, clean, and organize bioinformatics data using tidyr Create publication-quality plots, reports, and presentations using ggplot2 and Quarto Analyze RNA-seq, ChIP-seq, genomics, and next-generation genetics with Bioconductor Search for genes and proteins by performing phylogenetics and gene annotation Apply ML techniques to bioinformatics data using mlr3 Streamline programmatic work using iterators and functional tools in the base R and purrr packages Use ChatGPT to create, annotate, and debug code and workflows Who this book is for This book is for bioinformaticians, data analysts, researchers, and R developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems by learning via a recipe-based approach. Working knowledge of the R programming language and basic knowledge of bioinformatics are prerequisites.
دانلود رایگان مستقیم
شما میتونید سوالاتتون در باره کتاب رو از هوش مصنوعیش بعد از ورود بپرسید
دسترسی به کتابها از طریق پلتفرمهای قانونی و کتابخانههای عمومی نه تنها از حقوق نویسندگان و ناشران حمایت میکند، بلکه به پایداری فرهنگ کتابخوانی نیز کمک میرساند. پیش از دانلود، لحظهای به بررسی این گزینهها فکر کنید.
این کتاب رو در پلتفرم های دیگه ببینید
WorldCat به شما کمک میکنه تا کتاب ها رو در کتابخانه های سراسر دنیا پیدا کنید
امتیازها، نظرات تخصصی و صحبت ها درباره کتاب را در Goodreads ببینید
کتابهای کمیاب یا دست دوم را در AbeBooks پیدا کنید و بخرید
1192
بازدید4.5
امتیاز0
نظر98%
رضایتنظرات:
4.5
بر اساس 0 نظر کاربران
Questions & Answers
Ask questions about this book or help others by answering
No questions yet. Be the first to ask!