scanpy
نگهدارنده k-dense-ai
تحلیل single-cell RNA-seq با Scanpy
- نسخه فعلی
- نامشخص
- مجوز
- BSD-3-Clause
- دسترسی شبکه
- نامشخص / ارزیابینشده
- وضعیت بررسی
- تأیید نشده
چه مسئلهای را حل میکند؟
تحلیل اکتشافی scRNA-seq به QC، کاهش بُعد، clustering و بیان تفاضلی نیاز دارد.
چه زمانی مناسب است؟
برای QC، normalization، PCA/UMAP/t-SNE، clustering، differential expression، visualization یا تبدیل Seurat و SingleCellExperiment RDS به h5ad استفاده شود؛ برای deep learning از scvi-tools و پرسش format از anndata استفاده شود.
pipeline استاندارد single-cell RNA-seq برای QC، normalization، کاهش بُعد با PCA/UMAP/t-SNE، clustering، differential expression، visualization و تبدیل Seurat/SingleCellExperiment RDS به h5ad است.
نصب و بهروزرسانی
این دستورها فقط برای کپی نمایش داده میشوند و روی سرور RefHub اجرا نمیشوند. پیش از اجرا، منبع بالادستی پیوندشده را بررسی کنید.
دستور نصب
npx skills add k-dense-ai/scientific-agent-skills --skill scanpy -yسازگاری با ایجنتها
هنوز تست سازگاری ثبت نشده است
تا وقتی شواهد تست ثبت نشده، سازگاری این مهارت با ایجنتها را تأییدشده فرض نکنید.