pysam
نگهدارنده k-dense-ai
کار با فایل ژنومی Python/HTSlib با pysam
- نسخه فعلی
- نامشخص
- مجوز
- MIT
- دسترسی شبکه
- نامشخص / ارزیابینشده
- وضعیت بررسی
- تأیید نشده
چه مسئلهای را حل میکند؟
پردازش فایل ژنومی به I/O، query، filtering، coverage و index مناسب نیاز دارد.
چه زمانی مناسب است؟
برای SAM/BAM/CRAM، VCF/BCF، FASTA/FASTQ، tabix، pileup، coverage، indexing یا CRAM reference با pysam استفاده شود.
workflow pysam/HTSlib برای خواندن، query، filter یا نوشتن SAM/BAM/CRAM، VCF/BCF، FASTA/FASTQ و tabix با pileup، coverage، indexing و reference CRAM است.
نصب و بهروزرسانی
این دستورها فقط برای کپی نمایش داده میشوند و روی سرور RefHub اجرا نمیشوند. پیش از اجرا، منبع بالادستی پیوندشده را بررسی کنید.
دستور نصب
npx skills add k-dense-ai/scientific-agent-skills --skill pysam -yسازگاری با ایجنتها
هنوز تست سازگاری ثبت نشده است
تا وقتی شواهد تست ثبت نشده، سازگاری این مهارت با ایجنتها را تأییدشده فرض نکنید.