ngs-fastq-qc
نگهدارنده openai
اعتبارسنجی ورودیهای FASTQ، اجرای QC محلی FastQC/MultiQC و تفسیر سیگنالهای QC؛ با امکان اجرای fastp یا Cutadapt بدون بازنویسی readهای خام.
- نسخه فعلی
- نامشخص
- مجوز
- نامشخص
- دسترسی شبکه
- نامشخص / ارزیابینشده
- وضعیت بررسی
- تأیید نشده
چه مسئلهای را حل میکند؟
کیفیت FASTQ و trimming اختیاری بدون تغییر read خام را پوشش میدهد.
چه زمانی مناسب است؟
برای اعتبارسنجی FASTQ، QC محلی یا trimming با fastp و Cutadapt.
ورودیهای FASTQ را اعتبارسنجی، QC محلی FastQC/MultiQC را اجرا و سیگنالهای QC را تفسیر میکند و در صورت نیاز شاخههای trimming با fastp یا Cutadapt را بدون بازنویسی read خام اجرا میکند.
دسترسی و استفاده
در این رکورد کاتالوگ دستور مستقل نصب یا بهروزرسانی ثبت نشده است. برای روش استفاده، سند یا صفحهٔ منبع پیوندشده را ببینید.
سازگاری با ایجنتها
هنوز تست سازگاری ثبت نشده است
تا وقتی شواهد تست ثبت نشده، سازگاری این مهارت با ایجنتها را تأییدشده فرض نکنید.