Loading

gnomad-database

نگه‌دارنده google-deepmind

پرس‌وجوی Genome Aggregation Database (gnomAD) برای کمیابی یا فراوانی آللیِ واریانت‌های ژنتیکی، معیارهای محدودیت ژن (pLI، LOEUF)، واریانت‌های ناحیه/ژن و واریانت‌های ساختاری. برای ژنوم بیمار، جهش‌های سوماتیک سرطان از COSMIC و خوانش خام از ENA استفاده کنید.

نسخه فعلی
نامشخص
مجوز
نامشخص
دسترسی شبکه
نامشخص / ارزیابی‌نشده
وضعیت بررسی
تأیید نشده

چه مسئله‌ای را حل می‌کند؟

داده‌های gnomAD را برای سنجش کمیابی واریانت، محدودیت ژن و واریانت‌های ناحیه‌ای یا ساختاری فراهم می‌کند.

چه زمانی مناسب است؟

برای فراوانی یا کمیابی واریانت ژنتیکی، معیارهای pLI/LOEUF، واریانت‌های ژن یا ناحیه و واریانت‌های ساختاری استفاده کنید؛ برای ژنوم بیمار، جهش سرطان یا خوانش خام از این مهارت استفاده نکنید.

Genome Aggregation Database (gnomAD) را پرس‌وجو می‌کند. هنگام تعیین کمیابی یا فراوانی آللیِ واریانت‌های ژنتیکی مشخص، بازیابی معیارهای محدودیت ژن (pLI، LOEUF) برای سنجش نابردباریِ loss-of-function، یافتن واریانت‌ها در یک ناحیهٔ ژنومی یا ژن، یا پرس‌وجوی واریانت‌های ساختاری استفاده کنید. برای تحلیل ژنوم بیمار منفرد، ردیابی جهش‌های سوماتیک در سرطان (از COSMIC استفاده کنید) یا درخواست خوانش‌های خامِ توالی‌یابی (از ENA استفاده کنید) به کار نبرید.

نصب و به‌روزرسانی

این دستورها فقط برای کپی نمایش داده می‌شوند و روی سرور RefHub اجرا نمی‌شوند. پیش از اجرا، منبع بالادستی پیوندشده را بررسی کنید.

دستور نصب
npx skills add google-deepmind/science-skills --skill gnomad-database -y

سازگاری با ایجنت‌ها

هنوز تست سازگاری ثبت نشده است

تا وقتی شواهد تست ثبت نشده، سازگاری این مهارت با ایجنت‌ها را تأییدشده فرض نکنید.

منبع و وضعیت بررسی

توضیح بالا معرفی ساختاریافتهٔ کاتالوگ است و بازبینی تحریریه‌ای آن ثبت نشده؛ اطلاعات فنی و وضعیت راستی‌آزمایی جداگانه نمایش داده می‌شوند.

آخرین بررسی منبع
ثبت نشده