deeptools
نگهدارنده k-dense-ai
تحلیل NGS و مصورسازی ChIP/RNA/ATAC-seq با deepTools
- نسخه فعلی
- نامشخص
- مجوز
- BSD license
- دسترسی شبکه
- نامشخص / ارزیابینشده
- وضعیت بررسی
- تأیید نشده
چه مسئلهای را حل میکند؟
دادهٔ توالییابی برای QC، تبدیل فرمت و profile/heatmap به ابزار NGS نیاز دارد.
چه زمانی مناسب است؟
برای BAM to bigWig، QC، PCA، fingerprint، heatmap/profile، ChIP-seq، RNA-seq یا ATAC-seq visualization استفاده شود.
ابزار NGS برای تبدیل BAM به bigWig، QC با correlation/PCA/fingerprint، heatmap و profile TSS/peak و مصورسازی ChIP-seq، RNA-seq و ATAC-seq است.
نصب و بهروزرسانی
این دستورها فقط برای کپی نمایش داده میشوند و روی سرور RefHub اجرا نمیشوند. پیش از اجرا، منبع بالادستی پیوندشده را بررسی کنید.
دستور نصب
npx skills add k-dense-ai/scientific-agent-skills --skill deeptools -yسازگاری با ایجنتها
هنوز تست سازگاری ثبت نشده است
تا وقتی شواهد تست ثبت نشده، سازگاری این مهارت با ایجنتها را تأییدشده فرض نکنید.