arboreto
نگهدارنده k-dense-ai
استنتاج شبکهٔ تنظیم ژن با Arboreto
- نسخه فعلی
- نامشخص
- مجوز
- BSD-3-Clause license
- دسترسی شبکه
- نامشخص / ارزیابینشده
- وضعیت بررسی
- تأیید نشده
چه مسئلهای را حل میکند؟
شناخت interaction تنظیمی ژن به استنتاج GRN از expression data نیاز دارد.
چه زمانی مناسب است؟
برای bulk/single-cell RNA-seq، GRNBoost2، GENIE3، transcription factor-target relation یا dataset بزرگ استفاده شود.
شبکهٔ gene regulatory (GRN) را از expression data با GRNBoost2 و GENIE3 استنتاج میکند، transcriptomics bulk/single-cell، رابطهٔ transcription factor-target و computation توزیعشده برای dataset بزرگ را پشتیبانی میکند.
نصب و بهروزرسانی
این دستورها فقط برای کپی نمایش داده میشوند و روی سرور RefHub اجرا نمیشوند. پیش از اجرا، منبع بالادستی پیوندشده را بررسی کنید.
دستور نصب
npx skills add k-dense-ai/scientific-agent-skills --skill arboreto -y
سازگاری با ایجنتها
هنوز تست سازگاری ثبت نشده است
تا وقتی شواهد تست ثبت نشده، سازگاری این مهارت با ایجنتها را تأییدشده فرض نکنید.